
Разрабатываются проблемы совершенствования методов диагностики, лечения и профилактики острых и хронических бронхолегочных заболеваний; изучения биогенной фармакологии гипоксии и применение в медицине природных лекарственных средств.
Основными задачами научной деятельности университета являются:
1.Получение результатов научных исследований на уровне отечественных и мировых достижений;
2.Увеличение объемов научно-исследовательских работ;
3.Обеспечение подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации;
4.Совершенствование информационного обеспечения научных исследований и пропаганды их результатов;
5.Развитие научно-инновационной деятельности в системе профессионального медицинского образования и интеграционных процессов науки, образования и практического применения результатов;
6.Увеличение доли молодежи в сфере образования и науки.
Научно-исследовательскую работу университета координируют: проректор по научной работе и инновационному развитию, научно-плановый совет, 11 проблемных комиссий, отдел анализа и планирования научной деятельности, отдел подготовки научно-педагогических кадров, интеллектуальной собственности, отдел аспирантуры, ординатуры и магистратуры, этический комитет, комиссия по контролю за содержанием лабораторных животных, Центральная научно-исследовательская лаборатория (ЦНИЛ), Научно-клинический центр гематологии, онкологии и иммунологии (НКЦ ГОИ), научно-образовательный центр (НОЦ), центр практической психологии, 2 малых инновационных предприятия (МИП), виварий, Совет молодых учёных, студенческое научное общество (СНО).
Задачи научной работы в университете решаются следующим образом:
1. Ведение плановой научной работы кафедральными коллективами в соответствии с тематикой научных школ и приоритетными направлениями медицинской науки.
Научно-исследовательская деятельность в университете связана с сохранением и развитием научных школ, в становлении которых определяющую роль сыграли видные отечественные учёные: П.К.Анохин, Е.А.Строев, А.А.Никулин, В.И.Криков, Н.Г.Клюева, Н.И.Сметанин, Г.Г.Щёголев, И.Ф.Иваницкий, Г.А.Рихтер, А.И.Кузин, В.К.Белецкий, Л.С.Сутулов, Б.П.Кириллов, Л.В.Анохин, А.Ф.Белов, Ю.И.Ухов.
В настоящее время научные исследования осуществляются в рамках 16 сформированных научных школ и 14 научных направлений, охватывающих узловые проблемы современной медицины, биологии, фармации и гуманитарных наук, возглавляемых: Заслуженным работником высшей школы, проф. Узбековой Д.Г., проф. Якушевой Е.Н.; проф. Дубининой И.И., проф. Аристарховым В.Г.; Заслуженным деятелем науки Российской Федерации, проф. Гармашем В.Я., Заслуженным врачом Российской Федерации, проф. Абросимовым В.Н.; проф. Урясьевым О.М.; проф. Калининым Р.Е.; Заслуженным работников высшей школы проф. Лапкиным М.М.; Заслуженным врачом Российской Федерации, проф. Тарасенко С.В.; Заслуженным работников высшей школы, проф. Бяловским Ю.Ю., Заслуженным работников высшей школы, проф. Давыдовым В.В.; проф. Медведевой О.В., д.м.н. Артемьевой Г.Б., проф. Успенской И.В.; проф. Жадновым В.А.; д.м.н. Дмитриевым А.В., проф. Соловьёвым А.Е., д.м.н. Гребовой Л.П.: проф. Демиховым В.Г.; Заслуженным врачом Российской Федерации, проф. Якушиным С.С.; проф. Шустовым Д.И., проф. Володиным Б.Ю.; Заслуженным работником высшей школы, проф. Кирюшиным В.А., Заслуженным работником высшей школы, проф. А.А.Ляпкало; Заслуженным работником высшей школы, проф. Дармограем В.Н., д.фарм.н. Кузнецовым Д.А.; Заслуженным работником высшей школы, доц. Селезеневым Н.Г., д.б.н. Сычёвым И.А.; доц. Яковлевой Н.В.; проф. Акульшиным П.В., доц. Репиным Б.И.; проф. Низовым А.А.; проф. Бутовым М.А.; д.м.н. Хубезовым Д.А.; доц. Наримановой О.В., проф. Беловой Т.Н.; к.м.н. Деевым Р.В.; проф. Баковецкой О.В. и др.
Разрабатываются проблемы совершенствования методов диагностики, лечения и профилактики острых и хронических бронхолегочных заболеваний; изучения биогенной фармакологии гипоксии и применение в медицине природных лекарственных средств; исследования молекулярных механизмов эндокринной регуляции клеточных функций в норме и патологии; исследования системной организации сложных форм поведения в условиях нормы и стрессорных воздействий у человека и животных; эпидемиологии, клинико-биохимических аспектов и вопросов лечения ишемической болезни сердца; актуальных вопросов заболевания сосудов; разработки и внедрения новых эндоскопических методов в хирургическую практику; моделирования процессов импортозамещения на рынке продовольствия; педагогических и психологических аспектов развития личности и многие другие.